У другому циклі базової середньої освіти (7–9 класи) школи можуть використовувати такі програми:

• програми з предмета «Українська мова» (7–9 класи);
• програми з предмета «Українська література»;
• програми з предмета «Зарубіжна література» (дві програми — 7–9 класи й одна — 5–9 класи);
• програми з інтегрованого курсу літератур (українська й зарубіжна, 7–9 класи);
• програми з інтегрованого мовно-літературного курсу (українська мова, українська література, зарубіжна література, 7–9 класи)
• програми з предмета «Іноземна мова» (5–9 класи);
• програми з предмета «Друга іноземна мова» (5–9 класи);
• програми з предмета «Географія» (6–9 класи);
• програми з предмета «Фізика» (7–9 класи);
• програми з предмета «Біологія» (7–9 класи);
• програми з предмета «Хімія» (7–9 класи);
• програми з предмета «Історія України» (7–9 класи);
• програми з предмета «Всесвітня історія» (7–9 класи);
• програми з інтегрованого курсу «Історія: Україна і світ» (7–9 класи);
• програми з предмета «Інформатика» (7–9 класи);
• програми з предмета «Технології» (7–9 класи);
• програми з інтегрованого курсу «Математика» (7–9 класи);
• програми з предмета «Алгебра» (7–9 класи);
• програми з предмета «Геометрія» (7–9 класи);
• програми з курсу «Підприємництво і фінансова грамотність» (8–9 класи);
• програми з інтегрованого курсу «Здоровʼя, безпека і добробут» (7–9 класи);
• програми з інтегрованого курсу «Мистецтво» (7–9 класи).

Також затверджено програми для вивчення мов національних меншин і корінних народів, а також української мови для дітей, для яких вона не є рідною.

Перелік усіх модельних навчальних програм для 5–9 класів НУШ можна подивитися за цим посиланням.